2009年11月17日,科學技術處召開了學報(自然科學版)重新定位會議，學報(自然科學版)由原來的自然科學綜合類刊物,重新定位為食品科學類的專業期刊。2010年7月14日，科學技術處召開學報（自然科學版）創新與發展專家研討會，進一步明確刊物的辦刊方向。目前，主要欄目包括食品化學、食品貯藏與保鮮、食品機械與包裝技術、食品檢測與信息處理以及食品安全等，以學校提出的“大食品”的學科方向為指導，欄目基本覆蓋了學校的理工各科和文理交叉學科。

刊物重新定位后，在校領導的關心下，在主編孫寶國院士的親自指導下，科學技術處領導帶領學報編輯部的同志克服重重困難，做了大量開創性的工作。一是以提高學報質量為中心，多方位開展約稿工作：廣約行業名家稿件，加強了校內約稿，參加各類學術會議約稿，深入大型食品企業約稿。二是成立了由行業著名專家組成的編輯委員會。主編孫寶國院士親自聘請了國內食品行業著名專家南京農業大學副校長周光宏教授、江南大學食品學院院長張灝教授、天津科技大學副校長王碩教授以及中國農業大學胡小松教授等為學報的編委。三是辦精品期刊，聘請行業名家主持欄目。編輯部聘請了我校食品專業學科帶頭人宋煥祿教授主持食品化學欄目，幫助編輯部進行選題策劃并組織高水平稿件。四是與國際刊物接軌，加強了辦刊的規范化。為進入美國食品科技文摘（FSTA）做準備（進入核心期刊等的重要指標），從2010年1期起，全部文章都要有英文圖題和表題，還聘請了化工學院食品專業王靜老師做英文審讀工作。

目前，學報（自然科學版）已經基本完成了轉型工作。編輯部的同志們會根據學校的總體規劃，盡最大的努力，辦好這份刊物，打造為代表學校形象、提升學校形象的刊物。